Der er på Klintholms Natura 2000 arealer i 2012 gennemført et hegnings og rydningsprojekt med støtte fra Naturerhvervsstyrelsen.
Projektet har omfattet rydning af ca. 7,3 ha samt hegning af ca. 17,9 ha med ca. 4180 m hegn.
Projektet indeholder desuden en fangfold til hjælp ved indfangning af kreaturerne på arealet.
Udenfor projektet er opsat 3 stk. klaplåger, som letter publikums adgang til naturarealerne.
Naturområdet ved Klintholm er specielt på grund af geologien og tilstedeværelsen af klokkefrøer og planter, som trives i kalkrige omgivelser.
Klintholm I/S